Eine mobile Web-App ist im Kern eine mobile Website, die auf Basis von HTML5 zur mobilen Anwendung wird und von den gängigen mobilen Geräten aus aufgerufen wird. Web-Apps müssen nicht heruntergeladen und installiert werden. Der Programmcode läuft auf dem Browser. Ob eine Web-App der Programmierung einer nativen App Vorrang eingeräumt werden soll, kann allgemeinngültig nicht beantwortet werden. In Abhängigkeit von den Zielsetzungen und den gewünschten Features müssen die jeweiligen Vor- und Nachteile abgewogen werden.
Native Apps hingegen werden speziell für mobile Betriebssysteme wie iOS und Android entwickelt. In den meisten Fällen haben sie einen technischen Vorgsprung gegenüber Web-Apps, der sich weiter verkleinern wird.
Native Anwendungen sind kostspieliger in der Entwicklung, da sie für jedes spezifische Betriebssystem geschrieben werden müssen - iOS, Android (mehrere Geräte), Windows, etc.